Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.6 ms