Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NRIP2Q9BQI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP2Q9BQI9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NRIP2Q9BQI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP2Q9BQI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms