Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG2

NUDT12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT12Q9BQG2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDT12Q9BQG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDT12Q9BQG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDT12Q9BQG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUDT12Q9BQG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDT12Q9BQG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms