Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms