Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim8Q99PJ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim8Q99PJ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim8Q99PJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim8Q99PJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim8Q99PJ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim8Q99PJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim8Q99PJ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim8Q99PJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.4 ms