Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rtn4Q99P72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rtn4Q99P72 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rtn4Q99P72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rtn4Q99P72 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rtn4Q99P72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtn4Q99P72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtn4Q99P72 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms