Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Msh4Q99MT2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh4Q99MT2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh4Q99MT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Msh4Q99MT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh4Q99MT2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms