Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BrapQ99MP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BrapQ99MP8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BrapQ99MP8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BrapQ99MP8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BrapQ99MP8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BrapQ99MP8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms