Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtpbp4Q99ME9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtpbp4Q99ME9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtpbp4Q99ME9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms