Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt82Q99M74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt82Q99M74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt82Q99M74 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt82Q99M74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt82Q99M74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt82Q99M74 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms