Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q99M08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99M08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99M08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99M08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q99M08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99M08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99M08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99M08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99M08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q99M08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99M08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99M08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99M08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99M08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99M08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99M08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99M08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99M08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99M08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99M08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99M08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99M08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99M08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99M08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99M08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99M08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99M08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99M08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99M08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99M08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q99M08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q99M08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q99M08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q99M08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q99M08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q99M08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q99M08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q99M08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q99M08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q99M08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99M08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99M08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99M08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q99M08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q99M08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q99M08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q99M08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99M08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99M08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99M08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q99M08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99M08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q99M08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99M08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99M08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms