Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RtcbQ99LF4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RtcbQ99LF4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RtcbQ99LF4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RtcbQ99LF4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RtcbQ99LF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RtcbQ99LF4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms