Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NgrnQ99KS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NgrnQ99KS2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NgrnQ99KS2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NgrnQ99KS2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NgrnQ99KS2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 570.1 ms