Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PpifQ99KR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PpifQ99KR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PpifQ99KR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PpifQ99KR7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms