Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf34Q99KR6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf34Q99KR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf34Q99KR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf34Q99KR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf34Q99KR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf34Q99KR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms