Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dctn2Q99KJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn2Q99KJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn2Q99KJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dctn2Q99KJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms