Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubxn2aQ99KJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ubxn2aQ99KJ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2aQ99KJ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms