Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vwa5aQ99KC8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vwa5aQ99KC8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vwa5aQ99KC8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vwa5aQ99KC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vwa5aQ99KC8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vwa5aQ99KC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vwa5aQ99KC8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms