Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdxdc1Q99K01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdxdc1Q99K01 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdxdc1Q99K01 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdxdc1Q99K01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms