Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GDF15Q99988 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF15Q99988 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF15Q99988 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF15Q99988 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF15Q99988 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.7 ms