Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL3Q99963 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL3Q99963 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL3Q99963 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms