Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF18Q99633 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF18Q99633 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF18Q99633 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms