Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA3Q99618 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA3Q99618 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA3Q99618 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA3Q99618 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms