Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PIK3R4Q99570 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PIK3R4Q99570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3R4Q99570 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIK3R4Q99570 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3R4Q99570 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIK3R4Q99570 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms