Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
YME1L1Q96TA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YME1L1Q96TA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.53■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YME1L1Q96TA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
YME1L1Q96TA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
YME1L1Q96TA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms