Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETDB2Q96T68 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SETDB2Q96T68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SETDB2Q96T68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SETDB2Q96T68 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SETDB2Q96T68 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SETDB2Q96T68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SETDB2Q96T68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms