Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSPAN18Q96SJ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN18Q96SJ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms