Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UIMC1Q96RL1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UIMC1Q96RL1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UIMC1Q96RL1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UIMC1Q96RL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UIMC1Q96RL1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UIMC1Q96RL1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms