Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CITED4Q96RK1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CITED4Q96RK1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CITED4Q96RK1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CITED4Q96RK1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms