Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A2Q96QD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A2Q96QD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A2Q96QD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms