Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALS2CR12Q96Q35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms