Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG1Q96Q15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG1Q96Q15 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG1Q96Q15 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMG1Q96Q15 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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