Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORCS2Q96PQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS2Q96PQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SORCS2Q96PQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms