Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SCGB3A2Q96PL1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB3A2Q96PL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCGB3A2Q96PL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms