Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INPP4AQ96PE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
INPP4AQ96PE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
INPP4AQ96PE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
INPP4AQ96PE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms