Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPRD1AQ96P16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPRD1AQ96P16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPRD1AQ96P16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms