Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC43Q96MW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC43Q96MW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC43Q96MW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC43Q96MW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC43Q96MW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms