Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CFAP57Q96MR6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP57Q96MR6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP57Q96MR6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP57Q96MR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP57Q96MR6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP57Q96MR6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms