Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINC00615Q96LM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00615Q96LM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00615Q96LM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms