Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00208Q96KT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms