Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNDP1Q96KN2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNDP1Q96KN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNDP1Q96KN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNDP1Q96KN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNDP1Q96KN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms