Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM2Q96JY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM2Q96JY6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDLIM2Q96JY6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDLIM2Q96JY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDLIM2Q96JY6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDLIM2Q96JY6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDLIM2Q96JY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms