Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms