Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM12Q96EX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM12Q96EX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms