Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SIRT1Q96EB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SIRT1Q96EB6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SIRT1Q96EB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SIRT1Q96EB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIRT1Q96EB6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms