Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUS1Q96E22 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUS1Q96E22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUS1Q96E22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUS1Q96E22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUS1Q96E22 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUS1Q96E22 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUS1Q96E22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUS1Q96E22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1519.3 ms