Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE2Q96DL1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE2Q96DL1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE2Q96DL1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE2Q96DL1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE2Q96DL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms