Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXorf40BQ96DE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXorf40BQ96DE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf40BQ96DE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXorf40BQ96DE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms