Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN3Q96D15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN3Q96D15 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN3Q96D15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms