Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GCC1Q96CN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GCC1Q96CN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GCC1Q96CN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GCC1Q96CN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GCC1Q96CN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms